「懲教社教育基金」的前身為「懲教署儲蓄互助社」轄下的教育發展組。儲蓄互助社成立於1991年，社員必須是受聘於懲教署的職員，互助社根據香港法例119章<儲蓄互助社條例>成立，受香港政府漁農及自然護理署監管，主要提供儲蓄及貸款服務與社員，現有社員接近5000人。轄下的一個工作小組名為「教育發展組」，成立於2001年，目的希望透過社員的捐助，藉此協助國內貧困地區重建或維修校舍，資助教育設施、用品或學費，並提供當地學生有一個更美好的讀書環境，接受教育，亦從而發揚儲蓄互助社的互助精神。而基金亦會資助一些本地學校教育設施或用品。為了使匡扶教育的理念得以發揚光大，讓更多適齡學童有接受基礎教育的機會，「懲教社教育基金」於2003年8月1日正式成立，並成功註冊為一個非牟利的慈善團體。

教育基金之理事會是由一些懲教署職員及專業人士所組成，負責跟進每個教育專案的進度，並會定期開會檢討，以確保所籌得之善款能妥善運用。本基金除得到「懲教署儲蓄互助社」每年支持部份經費外，亦得到互助社社員于每年所得之股息中捐款資助，其他經費則來自各界熱心人士及機構。