「惩教社教育基金」的前身为「惩教署储蓄互助社」辖下的教育发展组。储蓄互助社成立于1991年，社员必须是受聘于惩教署的职员，互助社根据香港法例119章<储蓄互助社条例>成立，受香港政府渔农及自然护理署监管，主要提供储蓄及贷款服务与社员，现有社员接近5000人。辖下的一个工作小组名为「教育发展组」，成立于2001年，目的希望透过社员的捐助，藉此协助国内贫困地区重建或维修校舍，资助教育设施、用品或学费，并提供当地学生有一个更美好的读书环境，接受教育，亦从而发扬储蓄互助社的互助精神。而基金亦会资助一些本地学校教育设施或用品。为了使匡扶教育的理念得以发扬光大，让更多适龄学童有接受基础教育的机会，「惩教社教育基金」于2003年8月1日正式成立，并成功注册为一个非牟利的慈善团体。

教育基金之理事会是由一些惩教署职员及专业人士所组成，负责跟进每个教育项目的进度，并会定期开会检讨，以确保所筹得之善款能妥善运用。本基金除得到「惩教署储蓄互助社」每年支持部份经费外，亦得到互助社社员于每年所得之股息中捐款资助，其它经费则来自各界热心人士及机构。